A PROPESP, por meio de sua coordenação de pesquisa gerencia o cadastro e a certificação dos Grupos de Pesquisa solicitados por professores pesquisadores da UEA.
Os grupos de pesquisa contam com uma organização que envolve a participação do Dirigente Institucional, do líder do grupo, e de um corpo de pesquisadores com seus estudantes e técnicos. Tal organização também inclui as linhas de pesquisa e a pesquisa em si, que permite o envolvimento científico-profissional do pesquisador, assim como o compartilhamento de instalações e equipamentos.
A Universidade do Estado do Amazonas possui 135 Grupos de Pesquisa Cadastrados no Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico/CNPq, distribuídos em Grandes Áreas com suas respectivas Áreas Predominantes.